Himpunan Mahasiswa Budidaya Perairan dipimpin oleh seorang Ketua
Himpunan yang dibantu oleh sekretaris, bendahara, serta dua kepala
bidang yaitu bidang internal, dan bidang eksternal sebagai pengurus
inti. Bidang Internal membawahi tiga departemen yaitu yang pertama Departemen Pengembangan
Sumber Daya Manusia (PSDM), Departemen Penelitian dan Pengembangan
(LITBANG), serta Departemen Kewirausahaan (KWU). Sedangkan bidang Eksternal
membawahi Departemen, yang pertama ada Departemen Informasi dan Komunikasi (INFOKOM), Departemen Advokasi dan Kesejahteraan Mahasiswa (ADVOKESMA),
serta Departemen Publikasi Dekorasi Dokumentasi dan Multimedia (PDDM).
(Struktur Kepengurusan HMPBP Periode 2016 #BersamaBerkontribusi)